Nieuwe testen voor signaleren van ziekteverwekkers

Om de ecologie en de epidemiologie van ziekteverwekkers bij planten te bestuderen is het belangrijk dat meerdere micro-organismen tegelijkertijd snel en zorgvuldig worden opgespoord. Met de wereldwijd toenemende vraag naar voedsel is het belangrijk om het preventieve gebruik van pesticiden te verminderen en om de teeltopbrengst te vermeerderen. Dit kan door de aanwezigheid en hoeveelheid van bepaalde ziekteverwekkers te bepalen in een gewas, in het bewateringssysteem van kassen of in de grond, voordat ziektesymptomen zichtbaar zijn. Ook kunnen zulke technologieen duidelijke drempelwaarden van de hoeveelheid ziekteverwekkers bepalen, om zo informatie te krijgen waar ziektebestrijdingstrategieen op kunnen worden gebaseerd.

Van Doorn ontwikkelde een test die meerdere ziekteverwekkers bij planten kan opsporen en testte dit, zonder de betrouwbaarheid van ieder individueel ziekteverwekker te beinvloeden. Ziekteverwekkers kunnen van elkaar worden onderscheiden op slechts een enkel verschil in DNA-volgorde. Dit maakt het mogelijk om ziekteverwekkers te onderscheiden van zeer verwante, niet schadelijke organismen. Ook ontwikkelde Van Doorn een interne amplificatie controle (IAC) strategie om zo het remmen van qPCR ( een DNA-opsporingstechnologie die geremd kan worden door stofjes die in de grond zitten (zoals humuszuren)) in grondmonsters te onderzoeken. Deze strategie zorgt dat qPCR-remming betrouwbaar is te corrigeren en dat komt de betrouwbaarheid van de microbiologische kwantificering in grondmonsters ten goede.

De door Van Doorn ontwikkelde testen kunnen dienen als model om micro-organismen in diverse biologische systemen op te sporen en te identificeren waar meerdere en tegelijkertijd onderzoeken nodig zijn, afhankelijk van de situatie en gewenst door de gebruiker.

 

© Nieuwsbank